В целях обеспечения выполнения требований «Инструкции по контролю и обеспечению сохранения качества нефтепродуктов в организациях нефтепродуктообеспечения», утвержденной Приказом Минэнерго России от 19.06.2003г. №231, в системе ОАО «Башкирнефтепродукт» организован лабораторный контроль качества нефтепродуктов на всех этапах приёма, хранения и отпуска, как на нефтебазах, так и на АЗС силами ведомственных лабораторий.
Химико-аналитические лаборатории ОАО «Башкирнефтепродукт» оснащены современными приборами, позволяющими оперативно определять соответствие основных эксплуатационных и экологических параметров нефтепродуктов требованиям нормативно-технических документов.
Лаборатории аккредитованы Федеральным агентством по техническому регулированию и метрологии. Контрольные испытания нефтепродуктов проводятся в стационарных лабораториях, а при каждом приёме нефтепродуктов на нефтебазах и АЗС операторами проводятся приёмо-сдаточные анализы.
Результаты испытаний при приёме сравниваются с данными паспортов качества на поступившие нефтепродукты, прилагаемые к товарно-транспортным накладным.
Сертификация и инспекционный контроль нефтепродуктов осуществляется в соответствии с централизованными договорами, заключенными ОАО «Башкирнефтепродукт» с ООО «Башкирский центр сертификации и экспертизы». Органами государственного надзора и контроля проводятся ежегодные проверки на соответствие качества реализуемой продукции требованиям нормативных документов.